Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mid2Q9QUS6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Mid2Q9QUS6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms