Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdkl2Q9QUK0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdkl2Q9QUK0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms