Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME9

Vstm2b, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2bQ9JME9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2bQ9JME9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2bQ9JME9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms