Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmod4Q9JLH8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmod4Q9JLH8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms