Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pkd2l2Q9JLG4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pkd2l2Q9JLG4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms