Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trem1Q9JKE2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms