Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gpa33Q9JKA5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gpa33Q9JKA5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms