Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cnga3Q9JJZ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms