Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssna1Q9JJ94 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssna1Q9JJ94 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms