Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6l2Q9JIM3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6l2Q9JIM3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms