Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccl28Q9JIL2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Ccl28Q9JIL2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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