Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc22Q9JIG7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc22Q9JIG7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms