Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Prmt1Q9JIF0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prmt1Q9JIF0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms