Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LratQ9JI60 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LratQ9JI60 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LratQ9JI60 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms