Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHI7

Exosc9, Exosome complex component RRP45, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc9Q9JHI7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Exosc9Q9JHI7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Exosc9Q9JHI7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Exosc9Q9JHI7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms