Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
OtofQ9ESF1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
OtofQ9ESF1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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