Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SelenofQ9ERR7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SelenofQ9ERR7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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