Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tubb3Q9ERD7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tubb3Q9ERD7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms