Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Capn12Q9ER56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Capn12Q9ER56 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms