Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhox9Q9EQM5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rhox9Q9EQM5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms