Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r56Q9EPS9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r56Q9EPS9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms