Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rpgrip1Q9EPQ2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rpgrip1Q9EPQ2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms