Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Aph1cQ9DCZ9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms