Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pak1ip1Q9DCE5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms