Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SrpraQ9DBG7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrpraQ9DBG7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms