Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smg9Q9DB90 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smg9Q9DB90 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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