Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TrmuQ9DAT5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TrmuQ9DAT5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms