Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smim23Q9DAL0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim23Q9DAL0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms