Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9DA42 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q9DA42 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q9DA42 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9DA42 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9DA42 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9DA42 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9DA42 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9DA42 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms