Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z1

Knstrn, Small kinetochore-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KnstrnQ9D9Z1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KnstrnQ9D9Z1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KnstrnQ9D9Z1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms