Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mbd3l1Q9D9H3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mbd3l1Q9D9H3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms