Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cldnd2Q9D9H2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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