Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SlirpQ9D8T7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SlirpQ9D8T7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms