Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c6Q9D8P7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms