Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Derl3Q9D8K3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Derl3Q9D8K3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms