Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Alkbh4Q9D8F1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh4Q9D8F1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms