Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dnajc4Q9D844 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms