Protein–RNA interactions for Protein: Q9D809

2200002D01Rik, MCG22941, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2200002D01RikQ9D809 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
2200002D01RikQ9D809 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
2200002D01RikQ9D809 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms