Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab11fip1Q9D620 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms