Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc130Q9D516 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc130Q9D516 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms