Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmntd1Q9D4C1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lmntd1Q9D4C1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms