Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamp5Q9D387 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lamp5Q9D387 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms