Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nol3Q9D1X0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms