Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtl8bQ9D1F0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rtl8bQ9D1F0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms