Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Polr3eQ9CZT4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Polr3eQ9CZT4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms