Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2fQ9CY34 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2fQ9CY34 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms