Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX86

Hnrnpa0, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa0Q9CX86 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hnrnpa0Q9CX86 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hnrnpa0Q9CX86 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms