Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RpainQ9CWY9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms