Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pin4Q9CWW6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pin4Q9CWW6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Pin4Q9CWW6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pin4Q9CWW6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pin4Q9CWW6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms