Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ddx28Q9CWT6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms